考古发掘发现，放约沉船船体残长约米，放约最宽处保存约米，残存9道隔舱板和10个船舱，单层板结构，发现桅座、龙骨板、龙骨补强材以及舭龙骨等船体构件。

发掘出水文物标本约万件，定减度主要为龙泉青瓷和陶罐、铅锤、印章等船上生活、航海相关文物。

其中龙泉青瓷数量达到万余件，税提升通双赢器形包括碗、盘、碟、盏、洗、缽、香炉和高足杯等，年代为元代晚期，为典型的外销贸易瓷。

结合温州朔门古港的考古发现，进博推测该沉船可能是从温州港出海前往东南亚的民间贸易商船。

漳州圣杯屿沉船遗址的考古发掘通过科技创新、擦出设备改良实现了低能见度下水下考古精细化发掘，极大提升了我国水下考古发掘技术水平。

沉船、火花船货以及船上生活、航海相关文物的发现，对深入研究元代航海史、造船史和船上生活等具有重要价值。